עקרונות הבחירה למיקרוסקופים סטריאו כוללים בעיקר את ההיבטים הבאים:
דרישות רזולוציה: הרזולוציה של מיקרוסקופים סטריאו היא בדרך כלל בין 120-200 זוגות קו/מ"מ, תלוי במודל והתצורה. דגמים מתקדמים כמו סדרת Discivery Zeiss מצוידים במערכת תיקון סטייה כרומטית של APO ויש להם רזולוציה של עד 225 זוגות קו/מ"מ. בבחירתו יש לקחת בחשבון את תרחיש היישומים בפועל. לדוגמה, יש לבחור מיקרוסקופ עם רזולוציה גבוהה לאירועים בהם נדרשת תצפית בדיוק גבוה.
הגדלה וטווח זום: טווח ההגדלה של מיקרוסקופים סטריאו הוא בדרך כלל בין 6.5X ל- 225X, ויכול להגיע ל -450X עם עדשות נוספות. יחס הזום הוא בדרך כלל 6.3: 1 עד 20: 1. אם יש צורך בהתאמות הגדלה תכופות או מניפולציות לדוגמא, ראוי יותר לבחור מיקרוסקופ עם טווח זום גדול יותר.
מרחק עבודה ועומק שדה: מרחק העבודה הוא ביחס הפוך לרזולוציה, ומרחק העבודה נמצא בטווח של 92-110 מ"מ בתצורה סטנדרטית. התפרצויות נמוכות יותר מספקות עומק שדה גדול יותר ומתאימים להתבוננות בדגימות סטריאו.
שיטת מקור תאורה ותאורה: איכות מקור האור ושיטת התאורה ישפיעו גם על הרזולוציה בפועל. מקור האור LED עובד בצורה הטובה ביותר כאשר מדד העיבוד הצבעוני מגיע ל 90 ומעלה. לתאורת הטבעת ופונקציות הבקרה המפוצלות יש השפעה משמעותית על אפקט התצפית.
עיצוב ארגונומי: בהתחשב בעיצוב הארגונומי של המיקרוסקופ, זווית הנטייה של העינית בדרך כלל נוחה ביותר ב 35 עד 45 מעלות. מיקרוסקופים המשמשים במשך זמן רב צריכים להיות מצוידים באביזרים ארגונומיים כדי למנוע פגיעות מתח חוזרות ונשנות.
מותג ואיכות: בחרו מותגים אמינים ויציבים, כגון Zeiss, Leica וכו ', המובטחים מבחינת ביצועים אופטיים ועמידות.
